Başkanlık, siber güvenliğin sağlanması emeliyle siyaset, strateji ve maksatları belirleyecek, hareket planları hazırlayacak, mevzuat çalışmalarını yürütecek, ilgili faaliyetlerin uyumunu sağlayacak, siber güvenlik konusunda bilinçlendirme, eğitim ve farkındalığı artırma çalışmaları yürütecek, siber güvenlik ve bilgi güvenliğini destekleyici projeler yürütecek, bu alanda kamu, özel dal ve üniversiteler ortasındaki işbirliğinin artırılmasına yönelik çalışmalar yapacak.
Siber güvenlik ekosistemi ile yerli ve ulusal eser ve teknolojilerin geliştirilmesine ve yerli girişimcilerin dünya pazarında rekabetçi pozisyona gelmesine yönelik çalışmalar yapacak, siber güvenliğe ait gereksinim duyulan alanlarda Ar-Ge ve teknoloji transferi yapacak, siber güvenlik zafiyetinin tespit edilmesi için çalışmalar yürütecek, acil durum ve kriz idare planları oluşturacak, mevzuatla verilen başka misyonları uygulayacak.
Yurt içinde lider tarafından, yurt dışında liderin teklifi üzerine Cumhurbaşkanı kararıyla temsilcilik kurulabilecek.
Başkanlığın hizmet üniteleri ortasında; Siber Savunma Genel Müdürlüğü, Siber Mukavemet Genel Müdürlüğü, Ekosistem Geliştirme Genel Müdürlüğü, Dış Münasebetler Dairesi Başkanlığı, İdare Hizmetleri Dairesi Başkanlığı, Hukuk Müşavirliği, Basın ve Halkla İlgiler Müşavirliği yer alacak.
Başkanlık, misyon alanına giren mevzularla ilgili olarak bakanlıklar, kamu kurum ve kuruluşları, meslek odaları, sivil toplum kuruluşları, özel bölüm temsilcileri ve husus ile ilgili uzmanların iştiraki ile çalışma kümeleri oluşturabilecek.
